El club fue fundado el 2 de noviembre de 1909.
San Martín festeja este sábado su 115⁰ aniversario, previo a un partido decisivo que lo tendrá como protagonista, ya que este domingo a las 15 horas enfrentará a Aldosivi en el estadio de Rosario Central por la final de la Primera Nacional. Todas las miradas apuntan a ese enuentro trascendental, pero no hay que dejar pasar, que el 2 de noviembre de 1909, El Santo comenzaba a escribir su historia en las páginas del fútbol argentino.
Todo comenzó en la noche del 2 de Noviembre de 1909, cuando en la esquina noroeste de la Plaza San Martín nació el Club Atlético San Martín, con su bandera rojiblanca (colores inspirados en el de los granaderos) con el objetivo de unir al sector humilde de Tucumán, que hasta ese momento sólo contaba con dos clubes enfocados en la clase alta.
La idea que surgió en esa plaza luego se materializó en la casa de don Romelio Castro, quién fue nombrado como el primer presidente del Club.
Los primeros pasos de San Martín comenzaron en el gimnasio Saenz Peña, y después de muchos años de esfuerzo adquirió el terreno comprendido entre las calles Rioja, Rondeau, Alberdi y Bolívar, donde funcionó desde 1924 hasta 1930.
Por problemas económicos, la mudanza fue obligada y construyó su estadio en el medio de la Ciudadela, donde encontró su lugar en el mundo.
El Club Atlético San Martín se afilió a la AFA en 1968, y jugó en casi todos los Torneos Nacionales. Sus mejores participaciones fueron en 1985 (Tercera Fase) y 1982 (Cuartos de Final).
En la Temporada 1987/88 produjo un hecho histórico al clasificar desde los regionales al zonal Noroeste, el cual ganó; posteriormente participó en el Dodecagonal por el segundo ascenso a Primera División (al cual clasificó por haber ganado el zonal) también ganándolo y accediendo así a la primera división del fútbol argentino sin haber jugado el Nacional «B», un hecho inédito hasta hoy.
El 20 de noviembre de 1988 se convirtió en un día que ni el más fanático hincha del Santo hubiera soñado jamás. Esa tarde visitó a Boca y lo goleó por 6 a 1 en la mítica Bombonera. Tres goles de Antonio Vidal González, dos de Dante Unali y uno de Jorge López construyeron aquel inolvidable resultado.
Sin embargo, al final de esa temporada descendió, para retornar a la máxima categoría en 1992. Aunque los resultados tampoco lo acompañaron en ese entonces y a mediados de 1993 regresó a la B Nacional.
Luego de 15 años de competencia en el ascenso, el Santo logró el ansiado retorno a primera en 2008, pero tampoco pudo recolectar los puntos necesarios para quedarse más de un año, y a mediados de 2009 sufrió un nuevo descenso.
Campeón de la Copa de la República 1944
En 1944 participó por segunda vez del certamen y se consagró campeón de la Copa de la República 1944. Con este logro se convirtió en el primer club campeón de un campeonato de primera división, proveniente del interior en la era profesional. San Martín iguala 2 a 2 por los cuartos de final frente a Boca Juniors y logra avanzar por diferencia de tiros de esquina a favor (en esa época era la forma de desempatar ante una igualdad, pasaba quien más corners tenía a favor). La misma modalidad pasó en la semifinal contra Sarmiento (R) en Chaco, la diferencia a favor de tiros de esquina lo depositó en la final contra Newell’s partido el cual ganó por 3 a 1.
